11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4633 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4633  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1126  hypothetical protein  51.97 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890394  normal  0.601891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.47 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3340  hypothetical protein  30.51 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4526  hypothetical protein  27.31 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  35.9 
 
 		 77 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  37.93 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1341  hypothetical protein  34.29 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3276  putative transmembrane anti-sigma factor  31.82 
 
 		 80 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.953611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  31.65 
 
 		 78 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>