22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0657 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  54.26 
 
 
223 aa  251  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  40.27 
 
 
221 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  29.15 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  33.03 
 
 
219 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  29.41 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04335  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  26.37 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1694  CBS domain-containing protein  26.04 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1116  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.956192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  21.23 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  22.97 
 
 
200 aa  52  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  22.07 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  21.54 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  22.4 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  23.3 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  24.17 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.09 
 
 
493 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  23.49 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.43 
 
 
507 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  21.54 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0035  CBS domain-containing protein  20.11 
 
 
201 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  22.17 
 
 
209 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>