19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0400 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  337  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  53.9 
 
 
144 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  45.39 
 
 
140 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  44.37 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  40.94 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  40.43 
 
 
140 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  38.16 
 
 
149 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  38.16 
 
 
149 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  40.56 
 
 
149 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  42.61 
 
 
150 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  39.01 
 
 
150 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  44.35 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  38 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  42.61 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  34.64 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  27.73 
 
 
134 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>