More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  100 
 
 		 409 aa  808    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  68.18 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  69.6 
 
 		 407 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  63.2 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  65.31 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  59.3 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  56.78 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  60.66 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  56.78 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  56.78 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  59.03 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  59.09 
 
 		 386 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  59.35 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0722  acetate kinase  55.27 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0141081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  55.81 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  55.33 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0204  acetate kinase  56.68 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  57 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  54.68 
 
 		 385 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0623  acetate kinase  54.57 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  51.12 
 
 		 402 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  52.3 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  49.62 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  49.87 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  48.87 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  49.37 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  51.01 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  50.26 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  47.87 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  49.75 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  45.96 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  49.88 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  47.51 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  48.61 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  48.09 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46.25 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  45.2 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  48.36 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  48.26 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47.36 
 
 		 401 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  48.38 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  48.11 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  48.11 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.96 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.48 
 
 		 399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.75 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  46.21 
 
 		 399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  45.36 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  47.22 
 
 		 408 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  47.36 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  45.38 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  44.95 
 
 		 400 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.06 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  46.48 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  45.57 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  46.23 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  44.56 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  44.56 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  44.56 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  44.56 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  45.32 
 
 		 399 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  45.32 
 
 		 399 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  46.73 
 
 		 414 aa  358  9e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  45.73 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  48.36 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  45.55 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  43.43 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  44.31 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  45.06 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  52.78 
 
 		 395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.73 
 
 		 397 aa  356  5e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  45.52 
 
 		 411 aa  355  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  46.7 
 
 		 398 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  48.32 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  47.36 
 
 		 400 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  45.18 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  47.61 
 
 		 400 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  43.65 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.22 
 
 		 406 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  53.3 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  48.74 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  45.29 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  42.61 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>