32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15360  family 3 adenylate cyclase  100 
 
 
269 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5693  putative adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  24.24 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.22 
 
 
1149 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
731 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
667 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.95 
 
 
1081 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 
1138 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.66 
 
 
1226 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  25.13 
 
 
638 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.03 
 
 
1080 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
1148 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.13 
 
 
678 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
1151 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.8 
 
 
1089 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
1151 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  25.16 
 
 
483 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.85 
 
 
1141 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  23.4 
 
 
487 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
578 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.28 
 
 
611 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4435  putative adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 
735 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.63 
 
 
614 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 
1139 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 
741 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 
524 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.57 
 
 
1160 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.57 
 
 
1134 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 
370 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
643 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  25.44 
 
 
526 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>