32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  100 
 
 		 536 aa  1051    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  43.57 
 
 		 538 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  34.8 
 
 		 548 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  41.67 
 
 		 544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  26.92 
 
 		 611 aa  123  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  26.13 
 
 		 485 aa  97.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  26.34 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  26.79 
 
 		 679 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  25.88 
 
 		 709 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  29.88 
 
 		 659 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.58 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  29.47 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  25.75 
 
 		 679 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  27.22 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  27.03 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  27.1 
 
 		 538 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  23.24 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  24.38 
 
 		 610 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3397  Spore coat protein CotH  25.75 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  24.4 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3461  Spore coat protein CotH  26.55 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0390465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3317  spore coat assembly protein-like  25.75 
 
 		 557 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  24.37 
 
 		 798 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4674  cell surface protein  46.15 
 
 		 939 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0699989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  32.95 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  22.22 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  22.22 
 
 		 368 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  22.22 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  22.22 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  22.22 
 
 		 358 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  22.22 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  22.22 
 
 		 358 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>