18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0692 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0692  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0802  hypothetical protein  58.17 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0977  hypothetical protein  58.51 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1015  hypothetical protein  57.8 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0981  hypothetical protein  56.21 
 
 		 322 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2928  hypothetical protein  57.64 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1154  hypothetical protein  56.76 
 
 		 330 aa  359  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3780  hypothetical protein  58.25 
 
 		 303 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3511  hypothetical protein  57.14 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.529313  hitchhiker  0.00454263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3290  hypothetical protein  55.35 
 
 		 319 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1068  hypothetical protein  54.88 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00493933  normal  0.0171581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3426  hypothetical protein  54.86 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3386  hypothetical protein  54.88 
 
 		 319 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.022865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3261  hypothetical protein  50.5 
 
 		 282 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0739  hypothetical protein  51.3 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1618  hypothetical protein  47.57 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1861  hypothetical protein  44.48 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1112  hypothetical protein  23.76 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>