More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3460 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  100 
 
 		 81 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 75 aa  93.6  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  67.16 
 
 		 73 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 77 aa  90.5  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  62.32 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  62.32 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  62.69 
 
 		 77 aa  87  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  53.16 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  53.16 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  51.25 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  52 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  51.9 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  56.25 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  56.25 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  51.85 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  54.93 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  51.95 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  56.52 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  51.95 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  53.16 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  51.28 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>