287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4057 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  65.07 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  66.44 
 
 		 146 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  65.07 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  63.7 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  61.64 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  65.03 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  65.03 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  60.56 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  60.96 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  60.96 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  60.96 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  60.96 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  59.44 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  60.14 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  56.64 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  42.47 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  39.04 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  39.04 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  39.04 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  39.04 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  39.04 
 
 		 159 aa  126  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  39.04 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  39.04 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.04 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  41.1 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  41.1 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  41.1 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  43.97 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.04 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.03 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  39.73 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  40.58 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  41.3 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.85 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.44 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  39.86 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  36.2 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  35.04 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  37.25 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  34.44 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  34.44 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  34.44 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  33.11 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  33.77 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  35.76 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  35.76 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  34.44 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  33.77 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.77 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  33.77 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  33.77 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  33.77 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  32.43 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  36.6 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  32.43 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  32.43 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  32.43 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  33.11 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  32.43 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  33.11 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  33.11 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  31.08 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  31.08 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  33.11 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  31.13 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  32.45 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  31.13 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  31.13 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  32.43 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  31.76 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  31.08 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.25 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  31.13 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  31.13 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.94 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.86 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  29.05 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  29.05 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  29.05 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  34.27 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  31.47 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  30.77 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.14 
 
 		 607 aa  74.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.6 
 
 		 600 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  35.62 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  29.29 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  37.06 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.58 
 
 		 629 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.58 
 
 		 626 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>