34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1163 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  100 
 
 		 742 aa  1550    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  23.95 
 
 		 770 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  27.91 
 
 		 633 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  30.35 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  28.85 
 
 		 618 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  28.24 
 
 		 580 aa  115  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  28.14 
 
 		 673 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  28.89 
 
 		 615 aa  111  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  27.93 
 
 		 654 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 624 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  25.57 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  26.1 
 
 		 675 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 623 aa  99  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  27.2 
 
 		 638 aa  97.4  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  27.87 
 
 		 659 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  27.76 
 
 		 624 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  27.01 
 
 		 593 aa  92  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  26.56 
 
 		 651 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  28.01 
 
 		 551 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  26.99 
 
 		 580 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 616 aa  89.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  25.14 
 
 		 651 aa  85.1  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  24.58 
 
 		 619 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  27.7 
 
 		 483 aa  73.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  29.52 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  28.62 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  25.48 
 
 		 867 aa  68.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  22.53 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.3 
 
 		 1072 aa  63.9  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  24.49 
 
 		 580 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  23.26 
 
 		 578 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  24.91 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  20.58 
 
 		 507 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  22.58 
 
 		 572 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>