23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2116 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  676    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  50.46 
 
 
326 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  48.16 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  49.09 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  45.21 
 
 
341 aa  291  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  44.91 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  43.12 
 
 
333 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  41.57 
 
 
343 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  39.94 
 
 
348 aa  245  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  33.72 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  29.77 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  29.46 
 
 
329 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 
1055 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  24.54 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  27.9 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  28.26 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  27.9 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  22.1 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  22 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4587  hypothetical protein  22.28 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.330538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3196  hypothetical protein  21.38 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3246  hypothetical protein  21.38 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3184  hypothetical protein  21.38 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>