75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0003 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  88.46 
 
 
78 aa  139  2e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  50 
 
 
76 aa  67  9e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  55.77 
 
 
73 aa  61.6  3e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  54.9 
 
 
70 aa  61.2  4e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  54.9 
 
 
70 aa  61.2  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
70 aa  60.8  6e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
70 aa  60.8  6e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.93166e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
70 aa  60.8  6e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  60.8  6e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
70 aa  60.8  6e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  60.8  6e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  60.8  6e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.85 
 
 
67 aa  60.1  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  52.94 
 
 
70 aa  59.7  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  52.94 
 
 
70 aa  59.3  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  53.97 
 
 
148 aa  58.2  4e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.47 
 
 
70 aa  57.4  6e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  44.62 
 
 
73 aa  57  8e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.26771e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  52 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 
70 aa  53.1  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  44.26 
 
 
69 aa  53.1  1e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  52 
 
 
68 aa  53.5  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  53.06 
 
 
65 aa  52  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.56096e-07  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 
71 aa  51.6  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  44.62 
 
 
120 aa  50.1  9e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
68 aa  50.4  9e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  48.15 
 
 
76 aa  49.7  1e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  55.77 
 
 
117 aa  49.3  2e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  48 
 
 
80 aa  49.3  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  47.92 
 
 
58 aa  49.3  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  48 
 
 
76 aa  49.3  2e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.62 
 
 
62 aa  48.5  3e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  45.83 
 
 
58 aa  47.8  5e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  44.23 
 
 
77 aa  47.4  6e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  45.61 
 
 
73 aa  47.8  6e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  45.83 
 
 
58 aa  47.4  7e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  47  8e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  52.94 
 
 
125 aa  47  9e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  44 
 
 
72 aa  47  9e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.27 
 
 
80 aa  47  9e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  42 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  36.99 
 
 
72 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  47.92 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  42.59 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  40.98 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2397  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0714362  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  45.65 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  44 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  45.83 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  42 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  44 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  41.82 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  37.93 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  44 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  48 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  50 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  48.72 
 
 
49 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  34.92 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.65 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  38.18 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.9 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  42 
 
 
65 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.86446e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>