122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_R0036 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_R0036  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0026  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000025046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0031  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000375909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0078  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0027  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0024  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>