48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1998 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  299  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000213063  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2442  hypothetical protein  65.75 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000150553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1883  hypothetical protein  64.86 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000861185  normal  0.852169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1835  hypothetical protein  64.86 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1849  hypothetical protein  64.86 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000892049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1745  hypothetical protein  64.63 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2201  hypothetical protein  61.59 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2194  hypothetical protein  66.14 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0102079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2271  hypothetical protein  65.35 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2404  hypothetical protein  72.64 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1481  hypothetical protein  63.93 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0384358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2310  hypothetical protein  60.38 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000910912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4017  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0307  hypothetical protein  45.36 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3778  hypothetical protein  48.39 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0135  hypothetical protein  47.31 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4063  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0480  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0399153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0152  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2898  hypothetical protein  44.68 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4034  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4224  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0680  hypothetical protein  55 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.439614  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000960  hypothetical protein  38.53 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000106853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4154  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5200  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03592  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.50223  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03643  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4237  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212119  normal  0.0921479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4210  protein of unknown function DUF413  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3982  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4277  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4132  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24288  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4109  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4124  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4289  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0177  hypothetical protein  47.73 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_05  hypothetical protein  51.25 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4230  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4181  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01283  transposase  43.75 
 
 		 415 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000122879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4763  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0190  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.719352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3669  hypothetical protein  37 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.515559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0219  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00555  hypothetical protein  33.05 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0623  hypothetical protein  35.09 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>