48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2194 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2194  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0102079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2271  hypothetical protein  99.33 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2201  hypothetical protein  94.7 
 
 		 152 aa  292  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1745  hypothetical protein  91.28 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2404  hypothetical protein  93.33 
 
 		 150 aa  264  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2442  hypothetical protein  84.77 
 
 		 147 aa  257  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000150553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1883  hypothetical protein  83.66 
 
 		 149 aa  253  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000861185  normal  0.852169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1835  hypothetical protein  83.66 
 
 		 149 aa  253  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1849  hypothetical protein  83.66 
 
 		 149 aa  253  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000892049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2310  hypothetical protein  63.49 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000910912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1998  hypothetical protein  71.57 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000213063  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1481  hypothetical protein  56.38 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0384358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4017  hypothetical protein  46.73 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3778  hypothetical protein  49.47 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0135  hypothetical protein  48.42 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4063  hypothetical protein  48.42 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0152  hypothetical protein  48.42 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0480  hypothetical protein  48.42 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0399153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4289  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4124  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4109  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4230  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4181  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4210  protein of unknown function DUF413  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4154  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5200  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03592  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.50223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4237  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212119  normal  0.0921479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4277  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3982  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03643  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4132  hypothetical protein  42.99 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24288  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0307  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2898  hypothetical protein  45.74 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4224  hypothetical protein  45.26 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4034  hypothetical protein  45.26 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0190  hypothetical protein  43.69 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.719352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4763  hypothetical protein  44.21 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000960  hypothetical protein  39 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000106853  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0680  hypothetical protein  50.63 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.439614  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0177  hypothetical protein  44.32 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07000  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.515559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01283  transposase  42.05 
 
 		 415 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000122879  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0219  hypothetical protein  36.96 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_05  hypothetical protein  45 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00555  hypothetical protein  37.66 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0623  hypothetical protein  30.7 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>