48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1835 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1835  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1849  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000892049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1883  hypothetical protein  99.33 
 
 
149 aa  307  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000861185  normal  0.852169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2442  hypothetical protein  97.99 
 
 
147 aa  299  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000150553  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2201  hypothetical protein  86.84 
 
 
152 aa  265  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1745  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  265  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2194  hypothetical protein  83.66 
 
 
150 aa  253  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0102079  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2271  hypothetical protein  83.01 
 
 
150 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2404  hypothetical protein  84.11 
 
 
150 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144322  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2310  hypothetical protein  65.35 
 
 
146 aa  177  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000910912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1481  hypothetical protein  59.18 
 
 
142 aa  168  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0384358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1998  hypothetical protein  67.74 
 
 
145 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000213063  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4017  hypothetical protein  45.79 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3778  hypothetical protein  47.37 
 
 
112 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0135  hypothetical protein  47.37 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4063  hypothetical protein  45.26 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4289  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0152  hypothetical protein  45.26 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4124  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4109  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4230  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4181  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0480  hypothetical protein  45.26 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0399153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4210  protein of unknown function DUF413  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4154  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5200  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919853  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03592  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.50223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4237  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212119  normal  0.0921479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4277  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3982  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4132  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24288  normal  0.483124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03643  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4224  hypothetical protein  44.21 
 
 
112 aa  83.6  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4034  hypothetical protein  44.21 
 
 
112 aa  83.6  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0307  hypothetical protein  40.21 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0190  hypothetical protein  42.72 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.719352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4763  hypothetical protein  43.16 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2898  hypothetical protein  43.96 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000960  hypothetical protein  40.59 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000106853  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0680  hypothetical protein  49.37 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.439614  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07000  hypothetical protein  41.57 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01283  transposase  43.18 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000122879  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0177  hypothetical protein  40.66 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0219  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_05  hypothetical protein  45 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3669  hypothetical protein  34.26 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.515559  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00555  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0623  hypothetical protein  37.84 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>