58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0020 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0020  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  485  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1182  protein of unknown function DUF969  73.28 
 
 
239 aa  353  9e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1217  hypothetical protein  58.44 
 
 
239 aa  262  5e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414254  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3452  hypothetical protein  59.45 
 
 
229 aa  258  5e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.159434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2013  hypothetical protein  59.26 
 
 
229 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319899  normal  0.403491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3959  hypothetical protein  58.8 
 
 
229 aa  254  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4307  hypothetical protein  56.22 
 
 
229 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4532  hypothetical protein  57.92 
 
 
229 aa  253  1e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3466  hypothetical protein  56.22 
 
 
229 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553486  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4059  hypothetical protein  56.22 
 
 
229 aa  254  1e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1258  hypothetical protein  57.27 
 
 
243 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0785505  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5731  hypothetical protein  51.42 
 
 
249 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1170  hypothetical protein  57.6 
 
 
243 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.18885e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1118  hypothetical protein  57.6 
 
 
243 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3592  hypothetical protein  57.6 
 
 
243 aa  244  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2570  protein of unknown function DUF969  56.02 
 
 
228 aa  244  1e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0090  hypothetical protein  54.22 
 
 
243 aa  235  5e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0065  hypothetical protein  52.61 
 
 
244 aa  234  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0933  hypothetical protein  55.61 
 
 
229 aa  234  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262874  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3291  protein of unknown function DUF969  52.84 
 
 
239 aa  234  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2168  hypothetical protein  53.33 
 
 
239 aa  234  1e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.202836  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1971  protein of unknown function DUF969  53.33 
 
 
241 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988199  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2371  protein of unknown function DUF969  52.84 
 
 
245 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1601  normal  0.836703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0227  hypothetical protein  53.57 
 
 
247 aa  231  7e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0873  hypothetical protein  50.22 
 
 
247 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0192  hypothetical protein  50.45 
 
 
249 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3744  protein of unknown function DUF969  50.45 
 
 
249 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.79738  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0446  hypothetical protein  53.12 
 
 
338 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0250  hypothetical protein  53.12 
 
 
250 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0263  hypothetical protein  53.12 
 
 
250 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3371  hypothetical protein  53.12 
 
 
250 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2977  hypothetical protein  53.12 
 
 
250 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.226934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2114  hypothetical protein  53.12 
 
 
352 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0005  hypothetical protein  52.91 
 
 
261 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1378  hypothetical protein  54.88 
 
 
230 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0577  hypothetical protein  54.42 
 
 
230 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0656  hypothetical protein  54.42 
 
 
230 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2906  hypothetical protein  50.89 
 
 
254 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6525  protein of unknown function DUF969  47.58 
 
 
245 aa  197  2e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120098  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2881  protein of unknown function DUF969  54.4 
 
 
236 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2846  permease  48.28 
 
 
230 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2871  hypothetical protein  47.68 
 
 
231 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3099  hypothetical protein  48.07 
 
 
233 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2151  hypothetical protein  49.33 
 
 
231 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3085  hypothetical protein  49.33 
 
 
233 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3118  hypothetical protein  47.86 
 
 
231 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3117  hypothetical protein  48.07 
 
 
231 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2480  hypothetical protein  51.85 
 
 
217 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3094  hypothetical protein  48.9 
 
 
234 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2879  hypothetical protein  48.9 
 
 
234 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.225033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2807  permease  49.55 
 
 
234 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0437  protein of unknown function DUF969  43.5 
 
 
223 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  4.06355e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1415  hypothetical protein  40.57 
 
 
226 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0773605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1680  hypothetical protein  40.57 
 
 
226 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.936458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1372  hypothetical protein  41.75 
 
 
230 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.157148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1834  hypothetical protein  39.42 
 
 
227 aa  146  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.320572 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0177  hypothetical protein  36.2 
 
 
224 aa  140  2e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  8.13125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1237  protein of unknown function DUF969  31.28 
 
 
221 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>