More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0608 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  48.95 
 
 
193 aa  167  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  48.42 
 
 
193 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  48.42 
 
 
193 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  48.42 
 
 
193 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  48.39 
 
 
193 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.42 
 
 
193 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  47.89 
 
 
193 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  47.89 
 
 
193 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.89 
 
 
193 aa  164  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.85 
 
 
193 aa  164  6e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
192 aa  157  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.82 
 
 
206 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 
200 aa  138  4e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.82 
 
 
191 aa  130  8e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.79 
 
 
191 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.79 
 
 
191 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.27 
 
 
191 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.31 
 
 
191 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.79 
 
 
191 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.79 
 
 
191 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.79 
 
 
191 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 
191 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.27 
 
 
191 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 
233 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.1 
 
 
235 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.1 
 
 
235 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
259 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2777  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
184 aa  117  2e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.4 
 
 
259 aa  116  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3569  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
270 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
259 aa  114  7e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  34.78 
 
 
259 aa  114  7e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
199 aa  114  1e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  37.02 
 
 
213 aa  113  1e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
259 aa  113  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.62 
 
 
238 aa  113  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
261 aa  113  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.71 
 
 
234 aa  112  4e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
259 aa  112  4e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
261 aa  112  4e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 
259 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.71 
 
 
259 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.28 
 
 
193 aa  111  8e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.73 
 
 
265 aa  110  1e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  34.59 
 
 
259 aa  110  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.52 
 
 
237 aa  110  2e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3177  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  109  2e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.98 
 
 
266 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2434  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.22 
 
 
247 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
258 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
258 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.76 
 
 
258 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.76 
 
 
258 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.76 
 
 
258 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.76 
 
 
258 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.76 
 
 
258 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.76 
 
 
258 aa  108  7e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 
292 aa  108  7e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  29.76 
 
 
290 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.2 
 
 
223 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
249 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.2 
 
 
265 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 
261 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
199 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.10916e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
258 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.28 
 
 
272 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
206 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
262 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  30.96 
 
 
198 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 
198 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.42 
 
 
222 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
266 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  28.27 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 
261 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 
222 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.14 
 
 
244 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 
197 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.12 
 
 
268 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.86 
 
 
265 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  31.11 
 
 
201 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.54354e-09  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.36 
 
 
255 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.98 
 
 
197 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  29.21 
 
 
262 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
194 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 
200 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.7 
 
 
263 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.73 
 
 
222 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
256 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  35.4 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 
198 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
200 aa  97.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.7 
 
 
263 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  29.35 
 
 
211 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0837  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.74 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 
218 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.35 
 
 
272 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>