29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2794 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  94.44 
 
 		 234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  93.59 
 
 		 234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  93.59 
 
 		 234 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  86.75 
 
 		 234 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  84.19 
 
 		 246 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  84.19 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  83.76 
 
 		 246 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  83.76 
 
 		 246 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  72.96 
 
 		 233 aa  359  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  72.34 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  70.39 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000381321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  71.62 
 
 		 234 aa  339  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  70.64 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  69.96 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  65.6 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  65.67 
 
 		 234 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  62.34 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  65.09 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  62.34 
 
 		 234 aa  297  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  56.65 
 
 		 234 aa  296  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  59.66 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  59.23 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  58.11 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  48.94 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  49.1 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  21.08 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  23.92 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  23.44 
 
 		 364 aa  42  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>