18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0651 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  82.46 
 
 		 206 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  78.8 
 
 		 211 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  37.85 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  37.57 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  37.57 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  31.79 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  34.72 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  36.61 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  30.61 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  27.15 
 
 		 142 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  28.76 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  26.32 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  28.05 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  26.67 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>