40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2542 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  208  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  65.14 
 
 		 109 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  65.14 
 
 		 109 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  40.37 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  37.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  37.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  37.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  37.61 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  37.61 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  36.7 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  36.7 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  39.77 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  38.64 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  38.64 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  38.32 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  31.63 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  37.5 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  31.53 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  27.47 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  28.04 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  29.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  34.29 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0120  branched-chain amino acid transport  26.67 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000282674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  30.28 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  27.47 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  29.35 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  29.9 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  27.62 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  29.35 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  28.87 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  30.12 
 
 		 107 aa  40.8  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  29.59 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>