46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3120 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  82.23 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  81.73 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  32.04 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  31.86 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.22 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  33.8 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  40.52 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  30.89 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  29.57 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  27.6 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  32.8 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.95 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  33.14 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  31.75 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  31.71 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  25.6 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  34.09 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  37.82 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  31.52 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.59 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.36 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  30.66 
 
 		 294 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  27.67 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  30.66 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  32.77 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  32.02 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  30.47 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27.36 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  30.47 
 
 		 290 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  30.25 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  30.63 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  30.63 
 
 		 289 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  30.63 
 
 		 289 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  30.63 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  30.63 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  30.63 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.36 
 
 		 290 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  30.63 
 
 		 289 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  34.43 
 
 		 273 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>