More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1583 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  100 
 
 		 375 aa  755    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  89.83 
 
 		 374 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5349  L-asparaginase, type II  63.66 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  61.89 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  61.89 
 
 		 379 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  61.28 
 
 		 373 aa  421  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  61.28 
 
 		 366 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5042  L-asparaginase, type II  63.5 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  58.82 
 
 		 365 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3427  L-asparaginase, type II  55.88 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  57.62 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0564  L-asparaginase, type II  60.67 
 
 		 378 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1913  glutaminase-(asparagin-)ase  62.8 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.252419  normal  0.323954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  61.35 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07280  L-asparaginase, type II  59.54 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1917  L-asparaginase, type II  59.94 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2453  L-asparaginase, type II  58.6 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1955  L-asparaginase, type II  58.77 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3237  L-asparaginase, type II  58.89 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3493  L-asparaginase, type II  59.34 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2689  L-asparaginase, type II  59.54 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.373089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4048  glutaminase-asparaginase  57.23 
 
 		 350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46970  glutaminase-asparaginase  56.93 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013825  normal  0.0254019 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  50.76 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  50.75 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  51.79 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  49.11 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  49.25 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  49.38 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  50.3 
 
 		 338 aa  315  9e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  49.38 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  49.38 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  49.38 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  51.35 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  50.76 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  47.71 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  48.51 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  48.01 
 
 		 346 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  46.97 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  47.4 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  46.18 
 
 		 348 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2492  putative asparaginase/glutaminase  56.92 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  47.4 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  46.43 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  46.13 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  45.8 
 
 		 355 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  47.09 
 
 		 347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  47.09 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  47.09 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  47.09 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  45.35 
 
 		 348 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  46.05 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  46.71 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  42.42 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  46.38 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  46.38 
 
 		 348 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  46.38 
 
 		 348 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  46.48 
 
 		 346 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  44.95 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  52.19 
 
 		 316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  45.39 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  45.39 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  45.39 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  45.39 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  45.39 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  45.72 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  45.72 
 
 		 345 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  45.72 
 
 		 345 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  43.64 
 
 		 331 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  44.95 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  44.95 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  44.95 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  44.95 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  44.95 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  44.95 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  44.95 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  44.04 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  41.67 
 
 		 340 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  42.9 
 
 		 340 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  41.03 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  42.59 
 
 		 340 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  42.59 
 
 		 365 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  42.59 
 
 		 365 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  41.67 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  41.07 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  38.14 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  37.84 
 
 		 328 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  37.76 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  37.16 
 
 		 330 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  45.52 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  43.73 
 
 		 333 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0303  Asparaginase/glutaminase  39.29 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  37.76 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4029  asparaginase  40.95 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.404026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>