16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1632 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1632  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  100 
 
 
421 aa  860  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.23008e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2971  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  39.9 
 
 
423 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.881827  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0979  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  36.1 
 
 
431 aa  220  4e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2852  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  32.92 
 
 
510 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0739  CRISPR-associated TIGR02710 family  26.65 
 
 
428 aa  121  2e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0710  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  28.71 
 
 
402 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  5.82487e-07  normal  0.0172395 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0228  CRISPR-associated protein  28.03 
 
 
403 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0529  hypothetical protein  24.53 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.870043  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1796  hypothetical protein  28.48 
 
 
314 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3217  hypothetical protein  23.81 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3021  hypothetical protein  28.44 
 
 
465 aa  65.9  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2484  hypothetical protein  35.37 
 
 
156 aa  57  6e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0223  CRISPR-associated protein  24.59 
 
 
488 aa  55.1  2e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2684  CRISPR-associated TIGR02710 family  27.22 
 
 
465 aa  52  2e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1631  hypothetical protein  21.9 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  33.75 
 
 
1287 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>