17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3217 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  875    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3021  hypothetical protein  30.02 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2684  CRISPR-associated TIGR02710 family  29.63 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0223  CRISPR-associated protein  25.72 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1632  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  23.81 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000123008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0739  CRISPR-associated TIGR02710 family  24.52 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0228  CRISPR-associated protein  24.46 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0710  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  23.95 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000582487  normal  0.0172395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0707  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  24.3 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00583196  hitchhiker  0.00677654 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0979  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  24.03 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2971  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  26.05 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.881827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0529  hypothetical protein  24.76 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.870043  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1862  hypothetical protein  28.02 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1073  hypothetical protein  24.73 
 
 		 577 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3295  hypothetical protein  24.18 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.582236 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2852  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  24.48 
 
 		 510 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>