18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0228 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0228  CRISPR-associated protein  100 
 
 		 403 aa  809    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0710  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  58.81 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000582487  normal  0.0172395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2971  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  25.97 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.881827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1632  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  28.03 
 
 		 421 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000123008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0739  CRISPR-associated TIGR02710 family  28.05 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3217  hypothetical protein  24.46 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0979  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  25 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2852  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  27.49 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0529  hypothetical protein  25.81 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.870043  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3021  hypothetical protein  27.51 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1796  hypothetical protein  26.42 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2684  CRISPR-associated TIGR02710 family  26.5 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2449  hypothetical protein  21.88 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0223  CRISPR-associated protein  25.41 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1073  hypothetical protein  27.42 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3295  hypothetical protein  25.81 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.582236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1862  hypothetical protein  24.32 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>