12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2449 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2449  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1033    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2045  hypothetical protein  39.07 
 
 		 537 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.327546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0223  CRISPR-associated protein  27.71 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0710  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  22.77 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000582487  normal  0.0172395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1862  hypothetical protein  26.88 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3021  hypothetical protein  22.27 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2684  CRISPR-associated TIGR02710 family  21.37 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3295  hypothetical protein  23.04 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.582236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0228  CRISPR-associated protein  22.26 
 
 		 403 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1073  hypothetical protein  24.51 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2971  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  24.37 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.881827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>