15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3021 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3021  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  933    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2684  CRISPR-associated TIGR02710 family  75.32 
 
 		 465 aa  672    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3217  hypothetical protein  30.02 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0223  CRISPR-associated protein  30.6 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0707  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  25.54 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00583196  hitchhiker  0.00677654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0529  hypothetical protein  23.91 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.870043  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0979  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  33.33 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1632  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  28.44 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000123008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0228  CRISPR-associated protein  27.48 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2449  hypothetical protein  22.27 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2971  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  25.07 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.881827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0710  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  27.06 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000582487  normal  0.0172395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0739  CRISPR-associated TIGR02710 family  24.4 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2045  hypothetical protein  27.56 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.327546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1862  hypothetical protein  32.04 
 
 		 585 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>