31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0061 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  95.02 
 
 
221 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  50.45 
 
 
221 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  54.17 
 
 
222 aa  218  4e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  36.36 
 
 
237 aa  127  2e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  37.2 
 
 
217 aa  126  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  36.89 
 
 
255 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  112  4e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  33.17 
 
 
256 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  31.78 
 
 
258 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  34.02 
 
 
252 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  34.02 
 
 
252 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  31.05 
 
 
240 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  32.14 
 
 
230 aa  99  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  28.5 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  32.83 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  29.29 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  27.94 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  30.39 
 
 
306 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  31.22 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  30.77 
 
 
250 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  27.83 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  32.61 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  26 
 
 
241 aa  82.4  5e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  23.96 
 
 
239 aa  58.2  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  24.34 
 
 
206 aa  57.4  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  22.84 
 
 
214 aa  50.8  2e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1008  phosphate acetyltransferase  31.36 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4275  phosphate acetyltransferase  31.36 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1640  phosphate acetyltransferase  31.36 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>