52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3567 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3567  2-keto-3-deoxygluconate permease  100 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000241056  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5835  2-keto-3-deoxygluconate permease  76.43 
 
 		 332 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0835449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6105  2-keto-3-deoxygluconate permease  76.95 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4428  2-keto-3-deoxygluconate permease  73.68 
 
 		 346 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2588  2-keto-3-deoxygluconate permease  76.32 
 
 		 327 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.978377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4645  2-keto-3-deoxygluconate permease  69.91 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0828937  normal  0.0842003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  69.33 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1736  2-keto-3-deoxygluconate permease  60.82 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0242221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4329  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.31 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.16914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5010  2-keto-3-deoxygluconate permease  50 
 
 		 339 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5850  2-keto-3-deoxygluconate permease  50 
 
 		 339 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1707  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.1 
 
 		 335 aa  286  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0340212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4302  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.25 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405227  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4075  2-keto-3-deoxygluconate transporter  51.41 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03795  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.41 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.364325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03744  hypothetical protein  51.41 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4108  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.41 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.360818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4443  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.1 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4140  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.41 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1740  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.1 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5364  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.41 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3877  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.16 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4106  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.43 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2205  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.21 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3914  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.43 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0314  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.55 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5761  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.47 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4389  2-keto-3-deoxygluconate permease  53.2 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0176  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.58 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0694  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.62 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0811  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.62 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0754  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.3 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0708  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.3 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.155068  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1025  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.79 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0768  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.66 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0177  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.21 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0193  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.21 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00793033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0184  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.21 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0565535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0180  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.21 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000129613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03754  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.9 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0593  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.19 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2622  2-keto-3-deoxygluconate permease  38.44 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.424244  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0129  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.06 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0924  2-keto-3-deoxygluconate permease  36.28 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000214762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0749  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.23 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0985  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.23 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0284  2-keto-3-deoxygluconate permease  36.88 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000189316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1590  2-keto-3-deoxygluconate permease  34.42 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.23 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1447  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.43 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2025  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.43 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343811  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0449  2-keto-3-deoxygluconate permease  34.88 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>