52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4389 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4389  2-keto-3-deoxygluconate permease  100 
 
 		 303 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4075  2-keto-3-deoxygluconate transporter  90.52 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03744  hypothetical protein  90.52 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03795  2-keto-3-deoxygluconate permease  90.52 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.364325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4302  2-keto-3-deoxygluconate permease  90.52 
 
 		 329 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405227  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4108  2-keto-3-deoxygluconate permease  90.52 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.360818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4140  2-keto-3-deoxygluconate permease  90.52 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5364  2-keto-3-deoxygluconate permease  90.21 
 
 		 327 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4443  2-keto-3-deoxygluconate permease  90.21 
 
 		 327 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1707  2-keto-3-deoxygluconate permease  79.56 
 
 		 335 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0340212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1740  2-keto-3-deoxygluconate permease  79.94 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3914  2-keto-3-deoxygluconate permease  66.04 
 
 		 318 aa  418  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4106  2-keto-3-deoxygluconate permease  66.04 
 
 		 318 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5850  2-keto-3-deoxygluconate permease  63.98 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4329  2-keto-3-deoxygluconate permease  64.38 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.16914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5010  2-keto-3-deoxygluconate permease  63.98 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2205  2-keto-3-deoxygluconate permease  65.73 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5761  2-keto-3-deoxygluconate permease  63.41 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0314  2-keto-3-deoxygluconate permease  68.27 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3877  2-keto-3-deoxygluconate permease  58.23 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1025  2-keto-3-deoxygluconate permease  58.13 
 
 		 336 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03754  2-keto-3-deoxygluconate permease  61.57 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5835  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.64 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0835449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4428  2-keto-3-deoxygluconate permease  47.96 
 
 		 346 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4645  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.79 
 
 		 334 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0828937  normal  0.0842003 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6105  2-keto-3-deoxygluconate permease  54.8 
 
 		 326 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3567  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.26 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000241056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1736  2-keto-3-deoxygluconate permease  44.16 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0242221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.37 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2588  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.84 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.978377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0176  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.94 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0177  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.56 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0184  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.56 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0565535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0193  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.56 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00793033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0180  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.56 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000129613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0593  2-keto-3-deoxygluconate permease  36.71 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0694  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.76 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0811  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.76 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0754  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.44 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0708  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.44 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.155068  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0768  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.13 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2622  2-keto-3-deoxygluconate permease  32.6 
 
 		 347 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.424244  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0129  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.32 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1590  2-keto-3-deoxygluconate permease  31.51 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0924  2-keto-3-deoxygluconate permease  32.48 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0284  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.71 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000189316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0449  2-keto-3-deoxygluconate permease  34.01 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0749  2-keto-3-deoxygluconate permease  26.27 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0985  2-keto-3-deoxygluconate permease  26.58 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  27.39 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1447  2-keto-3-deoxygluconate permease  31.02 
 
 		 340 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2025  2-keto-3-deoxygluconate permease  31.02 
 
 		 340 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>