52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2588 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2588  2-keto-3-deoxygluconate permease  100 
 
 		 327 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.978377 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5835  2-keto-3-deoxygluconate permease  81.31 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0835449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6105  2-keto-3-deoxygluconate permease  82.72 
 
 		 326 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3567  2-keto-3-deoxygluconate permease  76.32 
 
 		 324 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000241056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4428  2-keto-3-deoxygluconate permease  79.1 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4645  2-keto-3-deoxygluconate permease  72.76 
 
 		 334 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0828937  normal  0.0842003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  71.07 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1736  2-keto-3-deoxygluconate permease  63.95 
 
 		 342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0242221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1707  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.7 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0340212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4302  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.89 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405227  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1740  2-keto-3-deoxygluconate permease  52.08 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4329  2-keto-3-deoxygluconate permease  47.99 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.16914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4443  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.9 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4075  2-keto-3-deoxygluconate transporter  51.9 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03795  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.9 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.364325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03744  hypothetical protein  51.9 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4108  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.9 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.360818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4140  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.9 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5850  2-keto-3-deoxygluconate permease  47.08 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5010  2-keto-3-deoxygluconate permease  47.08 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5364  2-keto-3-deoxygluconate permease  51.9 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3877  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.16 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3914  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.63 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4106  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.37 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2205  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.54 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0314  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.78 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5761  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.82 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4389  2-keto-3-deoxygluconate permease  53.2 
 
 		 303 aa  261  8e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0176  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.31 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0177  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.63 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0193  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.63 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00793033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0184  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.63 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0565535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0180  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.63 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000129613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0694  2-keto-3-deoxygluconate permease  43.3 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0811  2-keto-3-deoxygluconate permease  43.3 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0754  2-keto-3-deoxygluconate permease  42.99 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0708  2-keto-3-deoxygluconate permease  42.99 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.155068  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0593  2-keto-3-deoxygluconate permease  47.17 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1025  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.54 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0768  2-keto-3-deoxygluconate permease  42.68 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03754  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.36 
 
 		 283 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2622  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.13 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.424244  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0129  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.56 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0924  2-keto-3-deoxygluconate permease  34.88 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000214762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0749  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.22 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0985  2-keto-3-deoxygluconate permease  35.53 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0284  2-keto-3-deoxygluconate permease  37.69 
 
 		 331 aa  173  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000189316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1590  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.44 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.84 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1447  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.56 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2025  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.56 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343811  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0449  2-keto-3-deoxygluconate permease  33.23 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>