More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2954 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  94.87 
 
 		 78 aa  157  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  94.81 
 
 		 80 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  89.61 
 
 		 79 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  88.31 
 
 		 82 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  89.61 
 
 		 79 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  88.31 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  85.71 
 
 		 81 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  87.01 
 
 		 79 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  85.71 
 
 		 79 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  76.32 
 
 		 82 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  72.37 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  71.62 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  68.92 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  71.83 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  64.86 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  64.86 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  66.22 
 
 		 81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  66.22 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  66.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  61.33 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  62.16 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  59.21 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  58.11 
 
 		 80 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  59.46 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  53.42 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  54.93 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  52.78 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  58.9 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  58.9 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  48.68 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  48.68 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  49.4 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  52.11 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  48.68 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  51.35 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  45.95 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  52.11 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  49.3 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  46.75 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  48.65 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  47.89 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  46.75 
 
 		 88 aa  66.6  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  43.42 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  43.84 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  43.42 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  39.74 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  45.83 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  41.67 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  41.67 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  43.84 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  43.06 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  44 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1611  BolA family protein  43.84 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  36.36 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  44.44 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  50 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  39.47 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2203  BolA family protein  39.29 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  44.44 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  43.84 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  40.28 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  39.47 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  40.28 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  41.33 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  38.16 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  38.16 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  41.79 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  43.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  40.28 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  38.89 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  42.47 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  41.33 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  38.03 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  39.76 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  37.5 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  44.44 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  39.47 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  38.36 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  50.88 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  38.03 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  36.59 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  40.24 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  38.16 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  45.07 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>