31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1683 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  55.88 
 
 		 199 aa  218  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2474  phage prohead protease, HK97 family  56.17 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  47.92 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5507  peptidase U35 phage prohead HK97  37.27 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  35.33 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  40.85 
 
 		 186 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  43.33 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1458  phage prohead protease, HK97 family  36.47 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  33.17 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  39.39 
 
 		 177 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  32.67 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  32.67 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  32.67 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  39.46 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  32.46 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  31.91 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  31.91 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  38.78 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  38.78 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  32.91 
 
 		 506 aa  81.3  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  35.95 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  31.74 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  33.08 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  29.11 
 
 		 562 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  32 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  32 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  28.99 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  33.97 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  31.29 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  27.7 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>