15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3839 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3839  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00356032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1279  hypothetical protein  82.02 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1464  hypothetical protein  81.82 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0948  hypothetical protein  62.79 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7667  hypothetical protein  50.57 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1158  hypothetical protein  47.67 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3101  hypothetical protein  45.35 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5301  hypothetical protein  42.7 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1557  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1042  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5325  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6196  hypothetical protein  36.14 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6255  hypothetical protein  31.08 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0607  hypothetical protein  41.07 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4259  hypothetical protein  33.73 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116623  normal  0.995329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>