More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2945 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  75.73 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  67.96 
 
 		 104 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  68.93 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  69.9 
 
 		 104 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  64.08 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  63.46 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  61.54 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  58.25 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  61.17 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  61.76 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  59.8 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  62.14 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  58.82 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  58.82 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  63 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  63 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  60.58 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  61.54 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  59.41 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  57.84 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  59.62 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  60.4 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  54.9 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 107 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.92 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  59.41 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  59.62 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  53.85 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  51 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  53 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  51.96 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  55.77 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  52.94 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  58.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  53 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  49.02 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  49.02 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  57.84 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  62.07 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  62.07 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  52 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  59.55 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  60.92 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  60.92 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  60.92 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  58.43 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  47.12 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  47.12 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  59.77 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>