25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1839 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  85.8 
 
 		 162 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  84.57 
 
 		 162 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  84.57 
 
 		 162 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  62.82 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  60.76 
 
 		 159 aa  210  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  62.5 
 
 		 174 aa  206  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  43.15 
 
 		 302 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  43.24 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  43.84 
 
 		 301 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  42.86 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  44.44 
 
 		 301 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  41.78 
 
 		 302 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  44.14 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  43.31 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  40.82 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  32.21 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  30.92 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  27.89 
 
 		 286 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  27.46 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  23.94 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  23.94 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  28.26 
 
 		 337 aa  44.3  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  23.24 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  39.02 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>