27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3518 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  85.93 
 
 		 200 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  79.9 
 
 		 203 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  74.19 
 
 		 330 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  68.28 
 
 		 213 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  62.33 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  55.29 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  47.54 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  59.15 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  59.15 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  51.15 
 
 		 280 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  55.47 
 
 		 263 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  47.09 
 
 		 282 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  44.5 
 
 		 283 aa  131  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  42.77 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  42.13 
 
 		 379 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  42.42 
 
 		 378 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  42.42 
 
 		 378 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  37.65 
 
 		 374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  43.06 
 
 		 384 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  44.12 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  41.04 
 
 		 348 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  44.96 
 
 		 237 aa  88.6  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  41.48 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  33.52 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>