25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3445 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  94.44 
 
 		 162 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  92.59 
 
 		 162 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  84.57 
 
 		 162 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  63.29 
 
 		 163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  65.19 
 
 		 159 aa  217  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  59.48 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  41.78 
 
 		 302 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  46.48 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  42.47 
 
 		 301 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  42.47 
 
 		 301 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  41.78 
 
 		 302 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  39.86 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  42.07 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  43.31 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  31.54 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  29.41 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  27.46 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  27.54 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  27.54 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  26.28 
 
 		 337 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  26.81 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  26.53 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>