11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0809 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  89.66 
 
 		 173 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5244  hypothetical protein  73.45 
 
 		 177 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  47.5 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  29.52 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0643  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0745  hypothetical protein  35.48 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  27.23 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0779  hypothetical protein  45.71 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>