More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1814 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.89 
 
 
788 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.5 
 
 
818 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.08 
 
 
788 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  76.98 
 
 
797 aa  1243    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.36 
 
 
784 aa  795    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.48 
 
 
764 aa  757    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.25 
 
 
814 aa  702    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50 
 
 
812 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  84.94 
 
 
799 aa  1424    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
792 aa  789    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  61.81 
 
 
796 aa  986    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  52.34 
 
 
780 aa  772    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  95.65 
 
 
792 aa  1556    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.2 
 
 
787 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  100 
 
 
839 aa  1745    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.82 
 
 
793 aa  772    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  53.11 
 
 
793 aa  824    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.66 
 
 
788 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.33 
 
 
787 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  85.34 
 
 
797 aa  1423    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  85.3 
 
 
799 aa  1427    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  48.36 
 
 
825 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  53.35 
 
 
784 aa  801    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.16 
 
 
779 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.92 
 
 
800 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  56 
 
 
787 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  69.76 
 
 
797 aa  1178    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  82.5 
 
 
799 aa  1349    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.4 
 
 
787 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.16 
 
 
785 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.33 
 
 
787 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.8 
 
 
788 aa  822    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.88 
 
 
777 aa  806    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  51.18 
 
 
801 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  51.23 
 
 
802 aa  776    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.08 
 
 
788 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.82 
 
 
781 aa  776    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.12 
 
 
787 aa  770    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  56.32 
 
 
797 aa  854    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  56.17 
 
 
856 aa  868    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  52.76 
 
 
781 aa  792    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  52.93 
 
 
783 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.08 
 
 
787 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  49.68 
 
 
782 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  54.02 
 
 
777 aa  807    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  54.53 
 
 
787 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.23 
 
 
779 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.53 
 
 
784 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  86.39 
 
 
799 aa  1409    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.6 
 
 
801 aa  755    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  56.18 
 
 
784 aa  843    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.94 
 
 
767 aa  678    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  54.39 
 
 
781 aa  820    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  53.95 
 
 
787 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.83 
 
 
794 aa  887    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  82.63 
 
 
799 aa  1350    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  54.67 
 
 
787 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.32 
 
 
816 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  84.82 
 
 
799 aa  1421    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.17 
 
 
770 aa  765    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  48.24 
 
 
825 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.33 
 
 
787 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.09 
 
 
808 aa  741    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.23 
 
 
779 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.25 
 
 
785 aa  800    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  80.82 
 
 
798 aa  1334    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.2 
 
 
787 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.19 
 
 
779 aa  853    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.7 
 
 
823 aa  752    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.4 
 
 
799 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  44.79 
 
 
772 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.86 
 
 
801 aa  757    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.2 
 
 
787 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.34 
 
 
828 aa  724    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  50.46 
 
 
830 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.2 
 
 
787 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  43.59 
 
 
800 aa  635  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  42.41 
 
 
804 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  42.56 
 
 
767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  39.29 
 
 
1363 aa  534  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  38.99 
 
 
769 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  37.81 
 
 
1350 aa  515  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  37.15 
 
 
1387 aa  461  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  56.5 
 
 
825 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  56.28 
 
 
812 aa  435  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.19 
 
 
754 aa  337  7e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  30.43 
 
 
730 aa  303  8.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.96 
 
 
714 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  28.31 
 
 
715 aa  267  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.21 
 
 
772 aa  260  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2136  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.83 
 
 
768 aa  258  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  27.28 
 
 
753 aa  258  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  30.14 
 
 
782 aa  252  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1960  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.87 
 
 
763 aa  250  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.308037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2835  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, alpha subunit  29.65 
 
 
797 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  27.25 
 
 
713 aa  248  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.64 
 
 
774 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1504  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.49 
 
 
758 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2066  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.38 
 
 
1062 aa  237  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0951038  normal  0.0311361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.53 
 
 
757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>