11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0824 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918152 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  87.88 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  65.71 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  60.61 
 
 		 377 aa  50.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  57.14 
 
 		 388 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  55.56 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  61.29 
 
 		 387 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  61.76 
 
 		 394 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  60 
 
 		 407 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  54.29 
 
 		 379 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  54.84 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>