More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3248 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  98.8 
 
 
250 aa  491  1e-138  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  98.4 
 
 
250 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  79.2 
 
 
249 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  77.69 
 
 
247 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  77.11 
 
 
252 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  72.76 
 
 
249 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  78.06 
 
 
253 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  71.14 
 
 
251 aa  339  3e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  72.4 
 
 
251 aa  336  2e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  67.87 
 
 
254 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  66.12 
 
 
251 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1673  Integral membrane protein TerC  74.68 
 
 
248 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295174  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  66.26 
 
 
243 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  70.25 
 
 
253 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  64.9 
 
 
251 aa  320  9e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  64.9 
 
 
251 aa  320  9e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1566  integral membrane protein TerC  70.8 
 
 
248 aa  319  2e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.22924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  67.59 
 
 
255 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  64.34 
 
 
258 aa  315  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  65.4 
 
 
271 aa  311  6e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  64.8 
 
 
250 aa  311  8e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  68.7 
 
 
247 aa  309  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4488  Integral membrane protein TerC  64.8 
 
 
250 aa  309  3e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1845  Integral membrane protein TerC  72.88 
 
 
248 aa  308  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  65.82 
 
 
267 aa  308  7e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  65.4 
 
 
251 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  64.54 
 
 
263 aa  307  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  64.56 
 
 
251 aa  307  1e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  68.29 
 
 
247 aa  306  2e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  65.25 
 
 
274 aa  302  3e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  66.53 
 
 
251 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  66.53 
 
 
251 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  66.53 
 
 
251 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2551  integral membrane protein TerC  71.85 
 
 
257 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767156  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4110  integral membrane protein TerC  71.31 
 
 
256 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  66.8 
 
 
248 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  65.13 
 
 
250 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4942  Integral membrane protein TerC  73.22 
 
 
252 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1760  hypothetical protein  66.52 
 
 
244 aa  289  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  59.5 
 
 
259 aa  279  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2902  integral membrane protein TerC  65.82 
 
 
246 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.807584  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  54.32 
 
 
522 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  53.5 
 
 
522 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  53.94 
 
 
523 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  54.43 
 
 
518 aa  261  9e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  52.65 
 
 
522 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  54.85 
 
 
259 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  53.53 
 
 
518 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  53.11 
 
 
523 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  53.11 
 
 
523 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.85 
 
 
519 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.85 
 
 
519 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.85 
 
 
519 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.85 
 
 
519 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.85 
 
 
519 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  51 
 
 
518 aa  258  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  51.36 
 
 
510 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  51.48 
 
 
248 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  51.45 
 
 
238 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  51.82 
 
 
514 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  51.87 
 
 
523 aa  253  1e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  53.75 
 
 
515 aa  254  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.4 
 
 
516 aa  253  2e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.29507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.4 
 
 
518 aa  253  2e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.47451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.72 
 
 
253 aa  252  4e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  51.04 
 
 
252 aa  252  4e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  53.16 
 
 
238 aa  252  4e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  53.33 
 
 
515 aa  252  4e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  54.89 
 
 
259 aa  252  4e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  50.83 
 
 
529 aa  251  8e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  51.48 
 
 
238 aa  251  9e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  50.41 
 
 
249 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  52.23 
 
 
518 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  51.64 
 
 
250 aa  248  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.04 
 
 
239 aa  248  5e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  51.84 
 
 
247 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  51.08 
 
 
528 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  52.05 
 
 
522 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  49.79 
 
 
261 aa  246  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  51.44 
 
 
250 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  51.28 
 
 
253 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  51.52 
 
 
577 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
529 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  50.61 
 
 
518 aa  245  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  54.98 
 
 
237 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  54.98 
 
 
237 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.96217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  54.98 
 
 
237 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  54.98 
 
 
237 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  54.98 
 
 
237 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  9.95784e-07 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  49.79 
 
 
241 aa  243  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  48.97 
 
 
242 aa  242  4e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>