33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3713 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 		 244 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  69.71 
 
 		 242 aa  361  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  54.51 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  53.46 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  52.04 
 
 		 270 aa  276  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  53.17 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  51.82 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  51.81 
 
 		 259 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  55.86 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  45.42 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  47.39 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  41.23 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  41.63 
 
 		 221 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  41.67 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  41.67 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  45.57 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  44.3 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  41.18 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  43.61 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  43.43 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  39.19 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  39.19 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  39.19 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  38.74 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  43.41 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  42.31 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  31.4 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2175  hypothetical protein  31.62 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3032  hypothetical protein  30.4 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4931  hypothetical protein  25.4 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>