28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3591 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  100 
 
 		 251 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4450  KilA-N domain family  36.67 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000955205  unclonable  0.00000000145542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  48.11 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2280  KilA-N domain-containing protein  40.17 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0187873  decreased coverage  1.7596300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2154  KilA-N domain family  36.22 
 
 		 269 aa  92  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000036696  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1028  hypothetical protein  43.82 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.604601  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  27.72 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3253  KilA domain-containing protein  36.89 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000473609  decreased coverage  0.00000000000000635561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  33.08 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  33.81 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0561  KilA domain-containing protein  37.78 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  31.62 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  33.59 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  31.67 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  30.49 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  34.95 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  34.95 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0630  KilA-N domain family  31.4 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  hitchhiker  0.00000226954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2898  KilA-N domain protein  31.03 
 
 		 165 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.892571  hitchhiker  0.0000000704164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  34.59 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  34.59 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  34.59 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  34.59 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  29.23 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  32.76 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  29.37 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  29.37 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  32.35 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>