298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5278 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1523  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 686 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1492  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 686 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.352325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2161  polyphosphate kinase  52.28 
 
 		 720 aa  718    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  98.62 
 
 		 727 aa  1474    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  50.22 
 
 		 687 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02495  polyphosphate kinase  53.68 
 
 		 700 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  58.14 
 
 		 714 aa  812    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1536  polyphosphate kinase  51.24 
 
 		 737 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.753907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  98.66 
 
 		 747 aa  1513    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  88.15 
 
 		 736 aa  1350    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  51.61 
 
 		 736 aa  695    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0788  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 747 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0367  polyphosphate kinase  51.62 
 
 		 690 aa  716    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0342  polyphosphate kinase  51.47 
 
 		 690 aa  715    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  89.84 
 
 		 736 aa  1356    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1647  polyphosphate kinase  54.74 
 
 		 765 aa  761    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0834113  hitchhiker  0.000217098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  54.05 
 
 		 693 aa  759    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  52.83 
 
 		 694 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  53.42 
 
 		 712 aa  750    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1551  Polyphosphate kinase  50.43 
 
 		 701 aa  691    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.603175  hitchhiker  0.000343702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  56.26 
 
 		 688 aa  798    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1876  polyphosphate kinase  50.43 
 
 		 701 aa  691    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1626  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 747 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  58.94 
 
 		 690 aa  837    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  89.68 
 
 		 741 aa  1364    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  87.34 
 
 		 727 aa  1300    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4450  polyphosphate kinase  50.95 
 
 		 753 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  59.45 
 
 		 739 aa  890    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  53.54 
 
 		 703 aa  732    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0266  Polyphosphate kinase  54.41 
 
 		 691 aa  741    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2072  polyphosphate kinase  52.28 
 
 		 698 aa  716    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  58.33 
 
 		 693 aa  842    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  54.76 
 
 		 691 aa  767    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  51.9 
 
 		 747 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  82.68 
 
 		 740 aa  1222    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3654  polyphosphate kinase  64.16 
 
 		 702 aa  890    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0555564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  57.81 
 
 		 693 aa  801    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  50.36 
 
 		 687 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  62.23 
 
 		 733 aa  880    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2013  polyphosphate kinase  51.09 
 
 		 687 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1882  polyphosphate kinase  55.32 
 
 		 762 aa  770    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  51.31 
 
 		 693 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0570  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 686 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0676435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0890  polyphosphate kinase  50.51 
 
 		 687 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  57.23 
 
 		 694 aa  811    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  55.27 
 
 		 775 aa  782    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  83.76 
 
 		 736 aa  1233    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  57.54 
 
 		 694 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  95.85 
 
 		 746 aa  1444    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1184  polyphosphate kinase  51.24 
 
 		 687 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  83.62 
 
 		 736 aa  1233    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0581  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 686 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1196  polyphosphate kinase  51.24 
 
 		 687 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.905186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0822  polyphosphate kinase  53.88 
 
 		 695 aa  715    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1307  polyphosphate kinase  51.24 
 
 		 687 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  100 
 
 		 747 aa  1531    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  54.76 
 
 		 690 aa  801    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1278  polyphosphate kinase  51.24 
 
 		 687 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  51.61 
 
 		 723 aa  695    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  53.1 
 
 		 693 aa  746    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3577  polyphosphate kinase  61.6 
 
 		 712 aa  884    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1299  polyphosphate kinase  51.32 
 
 		 759 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561572  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1480  polyphosphate kinase  47.18 
 
 		 723 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2246  polyphosphate kinase  47.49 
 
 		 703 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2378  polyphosphate kinase  48.25 
 
 		 723 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2306  polyphosphate kinase  45.93 
 
 		 772 aa  615  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2212  polyphosphate kinase  47.24 
 
 		 701 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.729253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3601  polyphosphate kinase  47.21 
 
 		 686 aa  612  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.487429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2622  polyphosphate kinase  46.86 
 
 		 734 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.494843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1296  polyphosphate kinase  46.87 
 
 		 717 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4920  polyphosphate kinase  47.06 
 
 		 816 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268776  normal  0.200111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2017  polyphosphate kinase  46.31 
 
 		 700 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  45.39 
 
 		 708 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.28 
 
 		 727 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  43.6 
 
 		 713 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  43.97 
 
 		 722 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  43.97 
 
 		 722 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  43.67 
 
 		 709 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3008  polyphosphate kinase  46.72 
 
 		 698 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.93 
 
 		 708 aa  572  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  43.33 
 
 		 707 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  44.19 
 
 		 696 aa  568  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.59 
 
 		 710 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  45.38 
 
 		 702 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  42.71 
 
 		 713 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  44.31 
 
 		 713 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  41.44 
 
 		 743 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  43.07 
 
 		 720 aa  557  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  43.4 
 
 		 743 aa  556  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  43.56 
 
 		 702 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  42.61 
 
 		 695 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  43.59 
 
 		 700 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  43.68 
 
 		 715 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  42.84 
 
 		 721 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  42.78 
 
 		 720 aa  554  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  43.54 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  42.29 
 
 		 714 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  43.17 
 
 		 702 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  43.17 
 
 		 702 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  41.54 
 
 		 736 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>