298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4920 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1296  polyphosphate kinase  71.78 
 
 
717 aa  1017    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2306  polyphosphate kinase  67.15 
 
 
772 aa  949    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  50.53 
 
 
693 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  50.83 
 
 
688 aa  658    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3601  polyphosphate kinase  60.85 
 
 
686 aa  816    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.487429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  49.47 
 
 
691 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2017  polyphosphate kinase  67.4 
 
 
700 aa  918    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  49.2 
 
 
693 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2246  polyphosphate kinase  70.35 
 
 
703 aa  974    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1480  polyphosphate kinase  73.19 
 
 
723 aa  1010    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4920  polyphosphate kinase  100 
 
 
816 aa  1670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268776  normal  0.200111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3008  polyphosphate kinase  59.38 
 
 
698 aa  747    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235985  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2622  polyphosphate kinase  72.92 
 
 
734 aa  1062    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.494843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2212  polyphosphate kinase  68.44 
 
 
701 aa  940    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.729253  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2378  polyphosphate kinase  73.19 
 
 
723 aa  1008    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  49.77 
 
 
693 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  49.17 
 
 
693 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  49.12 
 
 
747 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  48.8 
 
 
693 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
712 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  48.95 
 
 
694 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  48.79 
 
 
690 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  49.34 
 
 
694 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  48.71 
 
 
736 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0890  polyphosphate kinase  48.9 
 
 
687 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  48.6 
 
 
687 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  48.41 
 
 
736 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1523  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
686 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0570  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
686 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0676435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  46.48 
 
 
714 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0788  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
747 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360404  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1626  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
747 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0581  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
686 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  48.45 
 
 
687 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  47.74 
 
 
736 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1492  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
686 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.352325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1299  polyphosphate kinase  48.54 
 
 
759 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  47.74 
 
 
723 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4450  polyphosphate kinase  47.86 
 
 
753 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246923  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2013  polyphosphate kinase  48.01 
 
 
687 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  46.98 
 
 
736 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1278  polyphosphate kinase  48.01 
 
 
687 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  47.34 
 
 
690 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1307  polyphosphate kinase  48.01 
 
 
687 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  46.98 
 
 
736 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  46.45 
 
 
739 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  46.55 
 
 
741 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1196  polyphosphate kinase  47.57 
 
 
687 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.905186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  47.21 
 
 
727 aa  602  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  47.06 
 
 
746 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  46.91 
 
 
727 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  47.06 
 
 
747 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1184  polyphosphate kinase  47.42 
 
 
687 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  47.7 
 
 
740 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  46.91 
 
 
747 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1536  polyphosphate kinase  47.52 
 
 
737 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.753907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  46.98 
 
 
733 aa  591  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1551  Polyphosphate kinase  46.62 
 
 
701 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.603175  hitchhiker  0.000343702 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2072  polyphosphate kinase  47.76 
 
 
698 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2161  polyphosphate kinase  47.76 
 
 
720 aa  582  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1876  polyphosphate kinase  46.62 
 
 
701 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  47.97 
 
 
694 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0367  polyphosphate kinase  41.36 
 
 
690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0342  polyphosphate kinase  41.36 
 
 
690 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  42.79 
 
 
775 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02495  polyphosphate kinase  48.31 
 
 
700 aa  559  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0822  polyphosphate kinase  48.08 
 
 
695 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3577  polyphosphate kinase  46.23 
 
 
712 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1882  polyphosphate kinase  43.48 
 
 
762 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3654  polyphosphate kinase  45.83 
 
 
702 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0555564  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0266  Polyphosphate kinase  47.58 
 
 
691 aa  552  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1647  polyphosphate kinase  43.09 
 
 
765 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0834113  hitchhiker  0.000217098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  43.6 
 
 
703 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  42.44 
 
 
727 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  41.75 
 
 
710 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  41.79 
 
 
713 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  41.45 
 
 
714 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  39.89 
 
 
722 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  39.89 
 
 
722 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  42.3 
 
 
703 aa  479  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  40.81 
 
 
743 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  39.53 
 
 
715 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  39.34 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  40.21 
 
 
702 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  40.18 
 
 
702 aa  463  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  39.22 
 
 
762 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  37.85 
 
 
709 aa  466  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  36.66 
 
 
681 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  38.55 
 
 
721 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  39.39 
 
 
744 aa  462  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  38.44 
 
 
754 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0826  polyphosphate kinase  48.02 
 
 
766 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  38.65 
 
 
702 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  38.26 
 
 
736 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  41.1 
 
 
721 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  38.3 
 
 
731 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  38.24 
 
 
695 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  37.76 
 
 
715 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  40.21 
 
 
697 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  38.99 
 
 
724 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>