More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4731 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  99.25 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  99.25 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  97.76 
 
 		 134 aa  266  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  94.03 
 
 		 134 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  93.28 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  91.79 
 
 		 134 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  90.98 
 
 		 139 aa  246  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  88.81 
 
 		 135 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  87.31 
 
 		 135 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  88.06 
 
 		 134 aa  237  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  75.76 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  72.93 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  69.7 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  68.94 
 
 		 136 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  66.41 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  63.43 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  63.43 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 146 aa  176  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  62.69 
 
 		 146 aa  176  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  63.28 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  63.28 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  64.23 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  60.47 
 
 		 136 aa  166  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  60.47 
 
 		 136 aa  166  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  59.38 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  56.72 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  59.52 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  59.52 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  60.32 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  58.73 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  58.73 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  58.73 
 
 		 148 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  58.02 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  59.52 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  59.52 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  58.73 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  58.73 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  58.46 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  56.25 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  56.25 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  56.92 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  52.99 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  55.81 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  56.69 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  57.94 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  57.14 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  57.94 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  55.04 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  55.12 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  57.14 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  57.94 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  57.94 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  55.81 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  58.4 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  58.4 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  56.35 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  55.56 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>