55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4616 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  96.77 
 
 		 186 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  95.16 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  90.86 
 
 		 186 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  74.72 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  74.57 
 
 		 189 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.84 
 
 		 188 aa  257  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  73.74 
 
 		 190 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  67.21 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  62.29 
 
 		 184 aa  214  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  40.66 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.34 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 		 198 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  28.65 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  28.41 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  35.59 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  32.78 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  32.78 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  28.16 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  28.07 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.54 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  28.07 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  28.07 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  27.49 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.02 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.02 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.87 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.14 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  35.59 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.83 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.64 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 307 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3359  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.31 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.72 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  31.28 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.71 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  32.92 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 		 312 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4195  hypothetical protein  23.7 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.76 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.14 
 
 		 325 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0505  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.97 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  24.16 
 
 		 282 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.65 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2455  hypothetical protein  46.97 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000416249  normal  0.293758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.7 
 
 		 329 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.54 
 
 		 318 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>