18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3429 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3429  lambda NinG family protein  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0894801  unclonable  8.56403e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3389  bacteriophage lambda NinG family protein  94.44 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2806  bacteriophage lambda NinG  49.25 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.08856  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2912  bacteriophage Lambda NinG protein  40 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000145708  hitchhiker  0.00000000000507965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0885  bacteriophage Lambda NinG protein  38.46 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1394  NinG recombination protein  39.6 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000538638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3541  bacteriophage Lambda NinG protein  39.51 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.071423  hitchhiker  0.0000000583568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3885  bacteriophage Lambda NinG protein  39.11 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1024  bacteriophage lambda NinG family protein  38.94 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3229  lambda NinG family protein  49.64 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.65785  hitchhiker  0.00866577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2275  bacteriophage Lambda NinG protein  35.53 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.148456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2827  bacteriophage Lambda NinG protein  35.75 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866172  normal  0.519662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1131  bacteriophage Lambda NinG protein  35.75 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.892227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4102  lambda NinG family protein  33.33 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000261218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1093  bacteriophage Lambda NinG protein  33.97 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1939  lambda NinG family protein  33.33 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0633866  hitchhiker  0.000032667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1061  bacteriophage Lambda NinG protein  35.23 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  hitchhiker  0.00000642825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0388  gp69  52.38 
 
 		 50 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000215347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>